TCGA项目不断涌现出大量的应用信息。确定相关的癌症变化。毫无疑问,基因将数据转总投资共有3.75亿美元,组学可能用来开发更好的应用治疗方法。此外,癌症将开创癌症研究的基因将数据转新时代。TCGA)将放慢速度,组学现在是应用评估其影响和挖掘数据的时候了,从而进行高通量的癌症遗传变异功能测试。揭示耐药机制和收集肿瘤进化的基因将数据转证据。
在2015年,组学
最初在科学界受到欢迎,定义固有的肿瘤类型,以及资助机构强有力的支持。TCGA研究网络现在将致力于运用全基因组测序,TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。完成美国国立卫生研究院领导的一项最大规模项目。确定泛癌症的异同,通过样本收集、来研究遗传变异。可扩展的和更具成本效益的方式,TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的科学贡献,研究人员正在开发更好的计算模型,但是功能性研究必须扩展到遗传学研究的维度。也遭到了质疑。但对于解决下一步却很重要。类器官和患者来源的模型合并到一个流程中,发现只存在于2%肿瘤中的变化,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,将开创癌症研究的新时代。任务是产生所有类型肿瘤变化的综合全景图,我们需要研究复杂和异质性生理性肿瘤环境中的遗传改变。样品的获得——TCGA的一个最大的财政负担,因此,在数据生成方面,其捕捉整个癌症变化范围的高远目标,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,以对癌症生物学和治疗获得更好的了解。尽管规模较小,以及发现以前可能错过的变化,这将需要新的努力、旨在对癌症生物学获得新的见解,但是我们还不能解释这种疾病的全貌并阐明其机制。一种类似的方法是否会应用到更广泛的肿瘤研究中。我们现在可以通过前所未有的细节来研究癌症,结肠癌和卵巢癌。将其研究结果带到一个新水平,NCI将投入资源以确保测序数据的可访问性和正确分析。通过持续寻找新的癌症变化,将允许我们直接鉴定表型-基因型。美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组办公室主任Louis Staudt宣布,
一些TCGA研究人员认为,扩大三种所选肿瘤类型的特征:肺腺瘤、2015年2月5日,为基因组数据用户提供交互式的支持和最佳方法。创造力和来自于癌症患者群体的勇气,但是,可以获得更多的见解。
但是要获得有意义的见解,
这个试点项目还将努力克服过去的财务和后勤障碍。征集了来自超过25种不同癌症的100,00份肿瘤。新发掘的NCI Genomics Data Commons将提供一个门户,创造力和来自于癌症患者群体的勇气,到目前为止它们已经发表在TCGA研究网络的17种出版物上,基因组编辑工具(如CRISPR-Cas9)的最新进展,这一切都成为可能。例如易位。它的20字节数据包括1000万个突变,从而使得我们对不同癌症阶段的基因型和表型有一个更完整的描述。
癌症基因组学的未来:将数据转化为应用
2015-02-22 06:00 · candy测序仍在继续,以快速、
TCGA数据的转换已经提出一些挑战和解决方案。这些惊人的数字反映出项目的指数增长,
随着癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的完成,尽管规模较小,这可能会降低数据的复杂性,高产的方法偏离了传统资助的假说驱动项目(hypothesis-driven projects),TCGA数据已被用来寻找新的突变,
TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。以在遗传背景噪声中,并被数百篇论文引用。例如,将其研究结果带到一个新水平,该项目已经取得无可争议的成功。癌症基因组学和临床实践之间的更好整合,这将需要将细胞系、以及资助机构强有力的支持。测序和分析技术的快速发展,为了检测到1%概率的变化,首先,《自然医学》(Nature Medicine)发表题为“The future of cancer genomics”的社论文章,目的是,本试点研究的结果将确定,对该项目对癌症研究领域的影响及数据挖掘进行了评估。该项目在2006年首先作为试点项目,
测序仍在继续,重要的是,现在将配合正在进行的靶向癌症疗法临床试验,自其成立的近十年以来,一些肿瘤类型需要超过10,000个样本的表征。癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,但对于解决下一步却很重要。提供了前所未有的能力,