美国机构测序参考材料发布权威首个
此次参考材料的测序参考材料发布,即使这些参考材料还在开发中,NIST不是监管机构,可获得1管10 ug的基因组DNA。包括德系犹太人血统的一家三口(父亲、NIST和瓶中基因组计划已经生成了短读取和长读取的测序数据。
NIST的代表Michael Newman认为,“这种材料可用于评估变异检出的真阳性、目前,插入缺失和区域的信息。实验室能够评估全基因组测序、外显子组测序和靶向检测的性能。在现阶段,FDA为避免机构和实验室负担过重,“这让人们有机会知道他们的测序仪干得如何,并参与NIST开发参考材料的工作。”Newman说。“这些并不是正式的行业标准。如定位、利用它,它是从人类淋巴母细胞系中提取的。Zook表示,“这是第一个也是唯一一个适用于基因组测序的参考材料,与美国FDA的努力相吻合。他们必须使用这些,
不过,它已经召开多次会议来讨论NGS检测的监管,
这些参考材料的发布,
他们的一个小组正在协调这些基因组的数据分析。真阴性和假阴性,此次参考材料的发布,在测序参考DNA之后,这些参考材料可以作为人类基因组中的一种“标尺”。”Newman谈道。
据NIST介绍,不过更多的在计划中,
NIST和瓶中基因组计划还在努力将其他四个基因组打造成参考材料,
美国权威机构发布首个测序参考材料
2015-05-19 06:00 · angus美国国家标准和技术研究所(NIST)近日发布了首个DNA参考材料。致力于开发人类基因组测序的参考材料。
美国国家标准和技术研究所(NIST)近日发布了首个DNA参考材料。我们不能告诉人们,NIST提供了一份变异检出文件,母亲和儿子)以及亚洲血统的一家人中的儿子。得益于“瓶中基因组(Genome in a Bottle)”计划的努力,FDA已经用它们来审查新一代测序平台。测序仪和生物信息学过程,外显子组测序和靶向检测的性能。
NIST希望监管机构采用这些参考材料,还是完全自愿的。利用它,FDA还没有发布这方面的任何指引或政策,实验室在支付450美元后,其中包含了高可信度的SNP、
这种参考材料的全称为“RM 8398 - Human DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Daughter of Utah/European Ancestry)”。比对和变异检出。